La coordinación civil-militar en la gestión y control del espacio aéreo y la provisión de servicios de navegación aérea resultan fundamentales para el desarrollo de la aviación civil y de las operaciones militares en el entorno del uso flexible del espacio aéreo y en la gestión de los nuevos escenarios del uso masivo de drones y operaciones de gran altitud y espaciales.
Como muestra de la necesidad y de la importancia de esta colaboración, en el año 2020, Enaire incorporó a su estructura la Dirección de Coordinación Civil- Militar, que ocupa un oficial general del Ejército del Aire y del Espacio con la misión de potenciar esta colaboración a todos los niveles. Estas colaboraciones se han materializado en ejercicios militares como SIRIO 22 en Canarias.
Enaire y el Ejército el Aire y del Espacio mantienen un contacto y colaboración constantes con el objetivo, siempre presente, de conseguir una aviación más segura, eficiente y sostenible, junto con el cumplimiento de las misiones del Ejército del Aire y del Espacio de vigilancia, seguridad y control del espacio aéreo de soberanía, y de vigilancia espacial.